Hrvatski Crveni križ provodi različite programe za zaštitu zdravlja te podizanje zdravstvene i ekološke kulture, a posebno radi na prevenciji bolesti i ovisnosti kod djece i mladih. Zdravstveni odgoj prilagođen je dobnim skupinama kroz razne metode rada (predavanja, javne tribine, radionice, igraonice), čime se u radu svih društava Hrvatskog Crvenog križa godišnje obuhvati oko 100 tisuća djece i odraslih soba. 

Programi zaštite zdravlja i prevencije bolesti obuhvaćaju: 

– prevencija i borba protiv širenja HIV/AIDS-a 

– programi prevencije ovisnosti 

– prevencija kroničnih nezaraznih bolesti 

– kroz program “Živjeti zdravo” – Zdravlje i tjelesna aktivnost te Zdravlje i okoliš 

– prevencija i suzbijanje tuberkuloze 

– iznenadni javnozdravstveni izazovi 

– zaštita zdravlja od vrućine 

– zaštita zdravlja od hladnoće 

– prevencija stradavanja stanovništva od mina i eksplozivnih ostataka iz rata